Сделал BAT-файл для конвертирования видео с видеокамеры из формата .MTS в .MP4:

@echo off
echo START
"C:\Program Files\ffmpeg\bin\ffmpeg.exe"  -i %1 -threads 4 -deinterlace -f avi -r 25 -vcodec libxvid -vtag XVID  -s 1920x1080  -aspect 16:9 -maxrate 1800k -qmin 3 -qmax 5 -bufsize 4096 -mbd 2 -bf 2 -flags +4m -cmp 2 -subcmp 2 -g 300  -acodec libmp3lame -ar 48000 -ab 128k -ac 2 %1.mp4
echo END
pause

Для работы скрипта соответственно понадобится FFMPEG для Windows, скачать можно отсюда http://ffmpeg.zeranoe.com/builds/win64/static/ffmpeg-20140227-git-b5005de-win64-static.7z и положить папку ffmpeg в папку C:\Program Files .

Отсюда взял большую часть параметров взял параметры: http://kosiara87.blogspot.ru/2011/06/converting-from-mts-to-h264-avi-using.html (статья про линукс).

Как пользоваться — по файлу .MTS правой — открыть с помощью — выбрать батник
Файл MP4 появится в этой же папке